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当部門で受け入れ可能な主な実験・解析

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RNA-seq 中級・上級者向け格安プラン 詳細

依頼者様に、RNA抽出~クオリティ確認~濃度調整まで行っていただく事で、コストを抑えたプランになります。基本的に哺乳類細胞や真核生物のmRNA-seqの適応になりますが、原核生物の場合は要相談としています。19,250円(学内料金)、25,020円(学外料金)となります。公的サービスのため消費税はかかりません。依頼者様は以下の条件を厳守しサンプルの提出をお願いいたします。            

  1. RNA抽出・精製後Nanodropで濃度を測定し、A260/230nm: 1.6以上、A260/280nm: 1.8以上となっている事をご確認ください。

  2. 通常の電気泳動(DNA電気泳動と同じアガロースゲル、TAE buffer)もしくはバイオアナライザーで全てのサンプルでRNA分解が見られない、または軽度であることをご確認ください。電気泳動の場合は28s/18sの比が1.6~1.8ぐらいが最適 あり、スメアがない事を確認ください。バイオアナライザーの場合はRIN値7以上を推奨します。

  3. RNAを100ng/ulに合わせ、総量で3~4ugのRNAが残っている事をご確認ください。

  4. 上記のRNAサンプルをご提出ください。

  5. 補足:上記のRNA総量よりも少ない場合でも対応可能ですが、ライブラリー作成が失敗してしまうリスクが高くなることをご承知おきください。その他不明点はお問い合わせください。データ解析の頻回なサポートが必要な場合はスポーツ医学分析部門との共同研究という位置づけで進めさせていただければと思います(最終的には依頼者様のご意向に沿った形で問題ありません)。

オフィス・ラボ:

〒305-8577

茨城県つくば市天王台1-1-1

医学系学系棟060号室

筑波大学 医学医療系 臨床検査医学/スポーツ医学研究室

RNA-seq 解析チーム 担当 菅澤

Tel : 029-853-3274

E-mail: t-sugasawa "at" md.tsukuba.ac.jp

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〒305-8577 茨城県つくば市天王台1-1-1
医学系学系棟060号室
筑波大学 医学医療系 スポーツ医学分析部門
研究責任者 菅澤
Tel: 029-853-3274

E-mail: t-sugasawa "at" md.tsukuba.ac.jp
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